Leistungszentrum Innovative Therapeutika
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Olink Plattform

Plattform für zielgerichtete Proteomik

Im Rahmen des Leistungszentrums TheraNova wurde eine skalierbare Plattform zur Quantifizierung von Proteinen aufgebaut, die die Identifizierung von Proteinbiomarkern in verschiedenen Bioproben wie z. B. Blut, Urin oder Gewebsflüssigkeiten ermöglicht. Biomarker finden u.a. in der klinischen Diagnostik sowie als Indikatorenfür die Therapieauswahl und Verlaufskontrolle Anwendung. Ferner tragen sie zu einem besseren Verständnis zugrunde liegender Krankheitsmechanismen bei.

Die Proteinquantifizierung erfolgt mit Hilfe der Proximity Extension Assay (PEA)-Technologie der Firma Olink Proteomics (Olink Homepage). Es stehen verschiedene Produkte zur Verfügung, welche es ermöglichen sowohl einige wenige Proteine (>5) als auch eine größere Anzahl an Biomarkern  (>1000 Proteine) mit einer hohen Spezifizität und Sensitivität zu quantifizieren. Für die Versuchsdurchführung werden nur sehr geringe Probenmengen benötigt, was vor allem für seltene und kleinvolumige Proben relevant ist. Neben Einzelprobenmessungen können auch Hochdurchsatzprojekte realisiert werden.

Weiterführende Informationen zur Technologieplattform (ITMP Homepage)

Einsatzgebiete und Leistungsangebote

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Präklinische und klinische Studien

  • Identifizierung diagnostischer, prognostischer und prädiktiver Biomarker
  • Identifizierung von Surrogatmarkern für Wirksamkeit und Sicherheit
  • Patientenstratifizierung

Wissenschaftliche Forschungsprojekte

  • Biomarkeranalysen in unterschiedlichsten in-vitro-, ex-vivo- und in-vivo-Modellen
  • Validierungsstudien
  • Mechanistische Analysen

Leistungsangebot

  • Messung von Einzelproben bis hin zu großen Kohorten (Hochdurchsatzanalysen) in longitudinalen Studien
  • Erarbeitung von Protokollen für die Probennahme und präanalytische Probenprozessierung
  • Studienbegleitung/Projektunterstützung von der Vorbereitung bis zur Datenprozessierung

1: Saul D, Lischer C, Bruns H, Ziegler N, Kannt A, Michel M, Mougiakakos D. OGG1 activation improves T cell resilience to oxidative stress after allo-SCT and T cell engager exposure. Leukemia. 2025 Dec;39(12):3037-3041. doi: 10.1038/s41375-025-02783-4. Epub 2025 Oct 15.PMID: 41094011.

2: Remih K, Hufnagel FM, Karl AS, Durkalski-Mauldin V, Lee WM, Karvellas CJ, Su Z, Rule JA, Tomanová P, Krieg L, Karkossa I, Schubert K, von Bergen M, Tacke F, Luckhardt S, Ziegler N, Kannt A, Engel B, Taubert R, Fontana RJ, Strnad P; US Acute Liver Failure Study Group. Serum proteomics of adults with acute liver failure provides mechanistic insights and attractive prognostic biomarkers. JHEP Rep. 2025 Jan 30;7(5):101338. doi: 10.1016/j.jhepr.2025.101338. PMID: 40242314; PMCID: PMC11998117.

3: Rischke S, Gurke R, Zielbauer AS, Ziegler N, Hahnefeld L, Köhm M, Kannt A, Vehreschild MJ, Geisslinger G, Rohde G, Bellinghausen C, Behrens F, Study Group C. Proteomic, metabolomic and lipidomic profiles in community acquired pneumonia for differentiating viral and bacterial infections. Sci Rep. 2025 Jan 14;15(1):1922. doi: 10.1038/s41598-025-85229-2. PMID: 39809876; PMCID: PMC11733231.

4: Youhanna S, Kemas AM, Wright SC, Zhong Y, Klumpp B, Klein K, Motso A, Michel M, Ziegler N, Shang M, Sabatier P, Kannt A, Sheng H, Oliva-Vilarnau N, Büttner FA, Seashore-Ludlow B, Schreiner J, Windbergs M, Cornillet M, Björkström NK, Hülsmeier AJ, Hornemann T, Olsen JV, Wang Y, Gramignoli R, Sundström M, Lauschke VM. Chemogenomic Screening in a Patient-Derived 3D Fatty Liver Disease Model Reveals the CHRM1-TRPM8 Axis as a Novel Module for Targeted Intervention. Adv Sci (Weinh). 2025 Jan;12(3):e2407572. doi: 10.1002/advs.202407572. Epub 2024 Nov 28. PMID: 39605182; PMCID: PMC11744578.

5: Roser LA, Luckhardt S, Ziegler N, Thomas D, Wagner PV, Damm G, Scheffschick A, Hewitt P, Parnham MJ, Schiffmann S. Immuno-inflammatory in vitro hepatotoxicity models to assess side effects of biologicals exemplified by aldesleukin. Front Immunol. 2023 Nov 17;14:1275368. doi: 10.3389/fimmu.2023.1275368. PMID: 38045689; PMCID: PMC10693457.